Hola Esther,
sí, pero lo más razonable es hacerlo en función del peso y que así 3 artículos sumen más.
Si necesitara programarlo por unidades estilo... si el pedido tiene unidades de X referencia coste de envío incrementado en 3 € por cada unidad también es viable.
No es fácil dar un presupuesto sin ver compatibilidad de los posibles módulos con las actuales formas de envío, pero no será muy caro.
Saludos,